Funksjonell genomikk · CRISPR-screening · Genredigering
Thomas Nelson Harvey
Forsker · Senter for integrativ genetikk (CIGENE), Fakultet for biovitenskap, Norges miljø- og biovitenskapelige universitet (NMBU)
Jeg forsker på hvordan genetisk variasjon gir opphav til egenskaper vi kan observere, og hvordan den kunnskapen kan bidra til bærekraft, bedre dyrevelferd og økt motstandskraft mot sykdom. Jeg utvikler metoder med høy gjennomstrømning, blant annet genomvide, samlede (pooled) CRISPR-screener og multiomikk, for å koble genotype til fenotype hos domestiserte dyr som atlantisk laks, gris og storfe. Jeg arbeider også med mikroorganismer, fra å utvikle mikroalger og sopp som produserer omega-3 og andre verdifulle fettsyrer, til å sekvensere det uvanlig store genomet til dinoflagellaten Crypthecodinium cohnii.
Dinoflagellaten Crypthecodinium cohnii, en industriell produsent av omega-3-fettsyren DHA, med den lange flagellen. Vi sekvenserer det uvanlig store genomet. Målestokk: 2 µm. Bilde: Thomas N. Harvey og Gareth Gillard.
Forskningsområder
Mer om forskningen min- 01
CRISPR-screening i genomet til domestiserte dyr
Vi slår av hvert enkelt gen, ett om gangen, for å finne dem som betyr noe.
- 02
Samspill mellom vert og patogen, og sykdomsresistens
Vi leter etter gener i verten som virus og bakterier er avhengige av.
- 03
Metabolisme og genregulering hos atlantisk laks
Hvordan fôr, livsstadium og genetikk påvirker fettomsetningen hos laks.
- 04
Mikrobiell genomikk og metabolsk design
Vi designer mikroorganismer som produserer verdifulle fettsyrer.
Utvalgte publikasjoner
Alle publikasjonerThe role of transposon activity in shaping cis-regulatory element evolution after whole-genome duplication
Genome Research, 35(3), 475–488
Efficient transfection of Atlantic salmon primary hepatocyte cells for functional assays and gene editing
G3: Genes, Genomes, Genetics, 13(4), jkad039